Вентилятор, конечно, жрет большой ток, но предохранитель там на 30А, и эти 30А он выжирает только при включении. Хотя, если все правильно работает, сначала должна включаться первая скорость, а потом уже вторая, когда вентилятор уже раскручен, поэтому значительного пика потребления не должно быть.
Может быть, нездоров мотор вентилятора и потребляет повышенный ток (хотя горел бы предохранитель), либо нездоров генератор и неравномерно нагружает двигатель. Но, я думаю, проблема все же в двигателе. Только поставил, но двигатель-то, видимо. вовсе не новый. Клапан ХХ перед установкой промывался? Вообще впуск разбирался?