Значит так. ИМХО.
Было 2,5 л. Стало 2,8 л. Расходомер остался старым. Это значит, что он полностью открывается при 6000 об/мин на 2,5 л., либо при 5400 об/мин на 2,8 л. При увеличении частоты вращения колена на 2,8 л. сверх 5400 об/мин расходомер уже не отслеживает увеличенный поток воздуха. Соответственно, форсунки тоже не льют больше, чем при 5400. Вот и получается бедная смесь. Немного спасти ситуацию могла бы лямбда, но скорее свего у тебя её нет.
Самый простой, но колхозный способ: увеличить жесткость пружинки на заслонке расходомера. Если и после этого смесь будет бедной, то увеличивать пропуск форсунок.
Вообще-то, правильнее поставить мозг "Мегасквирт", широкополосную лямбду и расходомер другой конструкции. Но это дорогое удовольствие, имеющее смысл при установке турбины.